观察水星凌日与观察太阳黑子的方法相似，必须借助望远镜。通常有两种观察方法：一是投影法，一是目测法。采用投影法时，通过望远镜把太阳投影到一张白纸上进行观察。采用目视法时，在望远镜的物镜上(前方)装上滤光镜，再进行观察。天文爱好者可以用烧电焊用的黑玻璃(防护镜)，也可以用X光底片或电脑软盘的磁片，几张重叠起来制成眼镜，戴上它用双筒望远镜观察水星凌日。
如何选购双筒望远镜?
一是口径(物镜)越大越好，物镜(前镜)直径70毫米的较理想。
二是选购多层镀膜的物镜。通常镀绿膜、蓝膜的质量较好，镀红膜的质量最差。需要着重指出的是，观察水星凌日，千万不能用肉眼直接看太阳，要注意保护眼睛。面对人生难得一遇的水星凌日，广东天文学会的专家建议各地有望远镜的天文爱好者应独立观察和拍摄水星凌日。
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